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中国农业科学院农业资源与农业区划研究所于2003年5月由中国农业科学院土壤肥料研究所（成立于1957年8月）、农业自然资源和农业区划研究所（成立于1979年2月）整合组建而成。是国内一流的以土壤肥料、农业资源利用和区域发展为主导的国家级公益性综合研究机构。
全所现有在职职工263人，其中中国工程院院士1人，具有高级职称研究人员110人，研究人员中52具有博士学位，研究生导师74余名。
作为国家级农业资源与环境研究中心，研究所以服务于国家经济建设、农业发展和农民增收为主要目标，以承担国家、国际合作研究项目、为本领域培养人才为主要任务。面向全国，研究探索农业资源环境领域中的理论与方法、农业发展战略、区域布局与结构调整、农业生产实用技术等问题，培养农业高级人才。主要研究领域涉及现代土壤、植物营养与肥料、农业微生物、资源遥感与数字农业、农业生态环境保护、节水农业、区域农业发展、农业资源管理与利用等。
研究所现有2个农业部重点开放实验室（“植物营养与养分循环”和“资源遥感与数字农业”重点开放实验室）；8个研究室；设有“国家化肥质量监督检验中心”、“农业部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心”和“中国农业微生物菌种保藏管理中心”；建有实验站（基地）9个；试验协作网3个；是全国农业资源信息中心和国土资源农业利用研究中心的依托单位，也是国家遥感中心农业应用部、农业部遥感应用中心研究部、中国植物营养与肥料学会和中国农业资源与区划学会的挂靠单位。研究所编辑出版《植物营养与肥料学报》、《中国土壤肥料》、《中国农业资源与区划》、《中国农业信息》和《农业科研经济管理》等学术刊物。
研究所设有农业资源利用学科博士后流动站，是农业资源利用一级学科博士培养单位，拥有植物营养学、土壤学、农业水资源利用、农业区域发展、农业遥感、草地资源利用6个博士学位授权点和1个作物生态博士学位授权点。拥有植物营养学、土壤学、农业水资源利用、农业区域发展、农业遥感、草地资源利用、环境工程和农业生态学8个硕士学位培养点。目前在读研究生150人（其中博士生62人、硕士生88人），博士后流动站24人。
研究所在植物营养、土壤、农业微生物资源保藏与利用、农业遥感应用、农业结构调整与区域发展、资源环境等方面具有强大的研究实力和技术优势，拥有我国长期农田土壤肥力质量监测基地和农业综合信息数据平台，包括覆盖全国的中、高精度数字化农田土壤肥力空间数据库和大比例尺的土地利用、气候、地形、农村经济和遥感图像信息。在土壤改良、施肥技术和粮食供求等方面拥有多项国家级科技成果，其中国家重大科技成果奖1项，国家创造发明一等奖1项，全国科学大会奖8项，国家科技进步奖13项，省部级奖142项，获发明专利16项。成果的应用率达80％以上，在国民经济中发挥了重要作用。
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